Este es el organigrama que contiene todas las personas que integran la institución del Ararteko.

En la institución del Ararteko hay 48 puestos de trabajo, aparte del propio ararteko Manuel Lezertua Rodríguez, y el puesto de adjunta al ararteko.

En el Ararteko hay un equipo de dirección integrado por el ararteko y la adjunta,  el secretario general, la directora de Relaciones Sociales, Estudios y Modernización y el director de Gestión económico-presupuestaria y de personal y administración, y cuenta con el apoyo de la responsable de Comunicación. El desempeño de los cargos de ararteko y adjunta son incompatibles con el desempeño de cualquier cargo.

En el seno del Ararteko funciona la Oficina de la Infancia y la Adolescencia, a cuyo frente hay una responsable, junto con la que trabaja una técnica.

Existe un equipo de once técnicos responsables de áreas (todos ellos juristas) más seis técnicos auxiliares para realizar los cometidos del Ararteko. Existen 28 áreas de trabajo, además de la Oficina de la Infancia y la Adolescencia. Al frente de cada una de ellas hay un técnico o técnica responsable, asistido, en algunas áreas, por un técnico auxiliar.

Hay tres oficinas de atención ciudadana en Vitoria-Gasteiz, Bilbao y Donostia / San Sebastián. Existe una persona responsable en cada una de las oficinas.

Además, hay 23 puestos de trabajo para atender diferentes servicios administrativos y técnicos: la atención telefónica, el registro, el auxilio administrativo a la gestión de los expedientes y las consultas, la contabilidad y la gestión presupuestaria, la gestión de personal, la traducción de documentos castellano/euskera, los sistemas de información o informática, la documentación, la biblioteca, el archivo, los servicios de ujier, la conducción del vehículo, el mantenimiento, la asistencia administrativa al ararteko y a la adjunta, así como a los directores y directoras.