El Ararteko elabora todos los años un anteproyecto de presupuesto que tiene que ser aprobado por  la Comisión de Gobierno y Reglamento del Parlamento Vasco, previo análisis del servicio de intervención. El presupuesto se incorpora al presupuesto del Parlamento Vasco como partida autónoma. El Ararteko dispone de autonomía en la gestión de su presupuesto pero ha de presentar anualmente la liquidación al Parlamento Vasco, que la ha de aprobar, previo análisis y visto bueno de su servicio de intervención.

Desde 2009, año en el que estalló la crisis, el presupuesto se ha reducido en 532.527,21 € (un 10,42 %)

PRESUPUESTO PARA EL AÑO 2015

La Comisión de Reglamento y Gobierno del Parlamento Vasco ha aprobado en la reunión celebrada el 11 de diciembre de 2014 el presupuesto del Ararteko correspondiente a 2015. El proyecto presentado por el Ararteko ha sido aprobado con los votos favorables de los representantes de EAJ-PNV. El PSE-EE y el PP se han abstenido. EH Bildu y UPyD han votado en contra.